Le isole del Dodecaneso non sono solo collegate geograficamente, ma anche storicamente. Erano ambite da molti invasori. I ritrovamenti archeologici hanno dimostrato che queste isole sono state abitate sin dal Neolitico. Al culmine della civiltà minoica molte delle isole del Dodecaneso avevano stabilito relazioni commerciali con Creta.

In questo momento storico gli abitanti comprendono i Carii e i Fenici. Fu quando i Dori si stabilirono nelle isole, che si scrisse un capitolo significativo della loro storia. il commercio marittimo si sviluppò notevolmente fino all'arrivo dei Persiani. Le isole del Dodecaneso entrarono a far parte della alleanza ateniese, come le Cicladi.

Durante l'occupazione romana vi fu un lungo periodo di declino e fu solo a partire dal XI secolo che si cominciò a vedere la loro ripresa economica.

Nel 1309 arrivarono i Cavalieri dell'Ordine di San Giovanni insieme a un periodo di importante sviluppi economico e culturale. Un esempio di questo è la città medievale di Rodi, un monumento insormontabile del patrimonio culturale.

Nel 1522 il Dodecanneso si arrese al dominio turco. Durante la Rivoluzione del 1821 gli abitanti si unirono nella lotta per la liberazione solo per essere ammessi alla Turchia in cambio di Evia. Il 1912 vide le isole sotto il controllo degli italiani fino a quando, finalmente, il 7 Marzo 1948, il Dodecanneso divenne greco.