In tempi antichi, le Cicladi sono stati il pomo della discordia tra i vari invasori provenienti dal Mediterraneo. In principio furono occupate dai Fenici e dai Carii. Seguono il regno minoico di Creta solo per cadere di nuovo nelle mani del Carii. Seguirono gli Ionii, ma furono cacciati dai Dori.

Quando cominciarono le guerre persiane, le Cicladi erano state occupate ancora una volta. Tutto questo continuò fino alla seconda guerra persiana. Tuttavia, in quel tempo, le isole si allearono con le forze armate di Atene. La situazione non era stabile, tuttavia, e durante la guerra del Peloponneso le Cicladi si schierarono con gli Spartani. uscirono da questa alleanza dopo la sconfitta degli Spartani nel 375 aC. Dovranno essere conoquistate dai Macedoni, Romani, Goti, Slavi, Turchi e Saraceni prima di diventare infine greci dopo la Rivoluzione del 1821.